如果储存不当，君山银针茶叶容易吸收异味和水分，导致口感不佳。茶叶发生不良变化的原因很多，如温度、湿度、异味、光线、空气、微生物等都会造成茶叶色泽和香气的损失。
瓦坛的保存：使用干燥无味无裂纹的瓦坛，茶叶用牛皮纸包裹，放入坛内，瓦坛内放一袋石子，用棉球封住坛口，每1-2个月更换一次石灰。这种方法主要是用石灰吸收水分来干燥茶叶，但缺点是存放时间过长，茶叶的香气会降低。
冰箱保存：将茶叶放入可密封的容器中，用透明胶带密封盖子，放入冰箱。春季存放，冬季取出，茶叶的色、香、味与存放时基本不变。这种方法简单易行。
保温瓶的保存：倒出热水。即使内壁有污痕或下部真空气孔破裂的热水器也可以使用，但水要彻底排除。然后把茶叶放进去，把瓶盖盖紧。
塑料袋储存：取两个无毒、无味、无孔的塑料食品袋，将干燥后的茶叶用柔软的白纸包好，放入其中一个袋中，轻轻挤压排出空气，然后用软绳将袋口绑紧，再将另一个塑料袋放回第一个塑料袋上，挤出空气绑紧，放入干燥、无味、密封的铁桶中。